El objetivo del programa de Sanidad y Bioseguridad es el de Fortalecer y consolidar el sector acuicultor colombiano, mediante actividades encaminadas a conocer, identificar, manejar y controlar las enfermedades del camarón y otras especies (cobia y tilapia) que representan un riesgo actual o potencial para su producción en Colombia.
EL programa consta de tres líneas de investigación:
1)Diagnóstico, 2)Control y prevención y 3)Estudio de interacción patógeno-medio ambiente-huésped.